Новият кросоувър на Skoda получи максималните пет звезди в първите изпитания за безопасност при катастрофа, проведени от Euro NCAP. Kodiaq осигурява 92-процентова защита на шофьора и пътника, което се смята за отличен резултат.
Чешкото SUV се представя добре и по останалите критерии като защита за деца (77%), пешеходци (71%), но комплексът от системи за безопасност, с които се оборудва моделът, получава рейтинг само 54% заради липсата на система за следене на движението в лентата (в тестваната модификация) и отсъствието на крепежи за детски столчета Isofix и i-Size на третия ред седалки.
Чешките инженери търпят критика и заради завишения риск от травми вследствие камшичен удар при пътниците на третия ред седалки и недостатъчната защита на гръдния кош на водача при челен сблъсък. От Euro NCAP обаче отбелязват високото равнище на безопасност за всички останали жизненоважни органи както за шофьора, така и за пътниците, и хвалят ефективността на системата за екстрено спиране при скорости до 8 км/ч.